Cell:相同突变导致不同表型的原因

    Cell发表多伦多大学的研究人员Andrew G. Fraser的一篇研究论文,论文通过检测了1400种基因突变的影响,发现许多突变可导致两种不同的表型的原因。


    在不同的人当中,相同的基因突变并不总是导致相同的表型,之前并无太多人了解该原因。多伦多大学Andrew Fraser说:“我们一个接一个地排查了了秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)基因组的基因,以探讨当我们敲除每个基因时会发生什么。”但是通过只对一个线虫品系进行研究,该研究团队意识到,他们可能会错过那些在不同线虫中产生不同影响的突变。所以他们花了近7年的时间,在2个线虫品系中筛查了1400个基因突变。


    Fraser指出:“如果你选取任何两个人类基因组,它们在大约每一千个位置中就有一个位置有所不同。这2个线虫基因组正好在同一水平上有所差异。”研究人员发现,大约20%的基因突变其严重程度在线虫之间存在差异。虽然一些只是细微的差异,另一些则是完全不同的,例如,几乎杀死一组动物,对另一品系并没有影响。当Fraser的研究团队在受不同表型突变影响的这些基因中深入研究基因表达水平时,他们发现,当一个突变在动物中引起一种更轻微的表型时,其相关的基因往往在一个较低的水平表达。这个发现并不意味着这是改变表型的唯一因素,但Fraser承认,目前它是最容易获得的。这也最有可能适用于人类的研究,在基因测序后分析表型变异,基因表达是最容易测量的。


    Fraser说:“如果你研究具有相同疾病易感性的不同个体,并进一步将他们进行分类,这将是非常有用的。你可以告诉一些人,你的病情将会比较轻微,你并不需要采用所有这些昂贵的药物。”


    当然,在人类中完成这项相同的研究将是棘手的——在研究人员有统计检力来分析疾病严重程度的差异之前,需要找到成千上万具有相同遗传变异的人。但是在秀丽隐杆线虫或其他模式生物中的进一步研究,可以为影响表型的具体风险因素与基因相互作用指明方向。


    原文链接:Natural Variation in Gene expression Modulates the Severity of Mutant Phenotypes.


    原文摘要:Many mutations cause genetic disorders. However, two people inheriting the same mutation often have different severity of symptoms, and this is partly genetic. The effects of genetic background on mutant phenotypes are poorly understood, but predicting them is critical for personalized medicine. To study this phenomenon comprehensively and systematically, we used RNAi to compare loss-of-function phenotypes for ∼1,400 genes in two isolates of C. elegans and find that ∼20% of genes differ in the severity of phenotypes in these two genetic backgrounds. Crucially, this effect of genetic background on the severity of both RNAi and mutant phenotypes can be predicted from variation in the expression levels of the affected gene. This is also true in mammalian cells, suggesting it is a general property of genetic networks. We suggest that differences in the manifestation of mutant phenotypes between individuals are largely the result of natural variation in gene expression.

 

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