一份详细研究报道指出在一种常见且难以治疗的乳腺癌中存在超过12,000种不同的蛋白，这将有助于解释为何这种癌症这么难治，为何无法对目前的药物治疗做出应答，同时也将能促进更多的靶点药物治疗研发。

    这一研究成果公布在本周(4月17日)的Cell Reports杂志上。文章的第一作者是来自华盛顿大学的Robert Lawrence，通讯作者是威斯康星大学Judit Villén助理教授。

    三阴性乳腺癌细胞与众不同，具有在其它许多乳腺癌中都很少发现的三种受体，其中两种受体是雌激素受体和孕酮，而另外一个受体是人类表皮生长因子受体2 (HER2)。

    在这项研究中，研究人员利用质谱技术识别并定量分析了20种乳腺癌细胞系，以及4个乳腺癌肿瘤样品中的蛋白。这一蛋白组学分析集合了多位学者的心血，是癌症研究，基因组研究和计算机科学的跨学科合作。

    质谱分析数据揭示了这些癌症样品中的亚型，分析癌细胞表达的蛋白类型，以及蛋白数量。“即使是同种癌症不同亚型的细胞，其蛋白表达也十分不同，这表明这些癌细胞有不同的行为表现，对治疗产生的反应也不同，”Lawrence说。

    为了能进一步探索基因，蛋白与药物应答之间的关联，研究人员又将关联分析了他们的蛋白质组学发现，现有的遗传学数据，以及16种细胞系中的药敏试验。

    研究结果解释了为什么对某个三阴性乳腺癌患者有效的药物，却无法治疗另外一位患者，其中原因之一就是某些三阴性乳腺癌肿瘤细胞表达的令细胞增殖的蛋白水平低，而令细胞扩散侵袭的蛋白的水平高。由于大部分常规的化疗靶向的都是促进增殖的途径，因此这些细胞就能对标准治疗产生抗性，那么按照这个思路，就可以利用那些靶向癌症扩散的药物进行治疗，这也许能提高三阴性乳腺癌治疗的疗效。

    “我们希望这将成为研究人员的资源，”Villén说，“研究人员能根据他们的目标蛋白找到类型和位置，看看它们在细胞中是如何表达的。或者也可以打入药物名称，看看哪些基因与蛋白与这种药物的肿瘤敏感性或者耐压性有关。”

    Villén 预计在未来一年里这一蛋白质组学分析将可以用于临床实验。目前，利用质谱技术她的实验室可以在 24小时内分析一个肿瘤样本。她预计一旦研究人员能确定出100个左右的重要蛋白，那么这一时间将能缩短到1个小时。

    这项分析将能为乳腺癌诊断提出更多详细的信息，也将能用于耐药性肿瘤的治疗。

    原文标题：The Proteomic Landscape of Triple-Negative Breast Cancer

    原文摘要：Triple-negative breast cancer is a heterogeneous disease characterized by poor clinical outcomes and a shortage of targeted treatment options. To discover molecular features of triple-negative breast cancer, we performed quantitative proteomics analysis of twenty human-derived breast cell lines and four primary breast tumors to a depth of more than 12,000 distinct proteins. We used this data to identify breast cancer subtypes at the protein level and demonstrate the precise quantification of biomarkers, signaling proteins, and biological pathways by mass spectrometry. We integrated proteomics data with exome sequence resources to identify genomic aberrations that affect protein expression. We performed a high-throughput drug screen to identify protein markers of drug sensitivity and understand the mechanisms of drug resistance. The genome and proteome provide complementary information that, when combined, yield a powerful engine for therapeutic discovery. This resource is available to the cancer research community to catalyze further analysis and investigation.