Nature Genetics :靶向作用染色体重排可治疗儿童恶性白血病





    近日,一项刊登于国际著名杂志Nature Genetics上的研究论文中,来自圣裘德儿童医院的研究人员通过研究发现,急性淋巴细胞白血病(ALL)的儿童机体中除了影响MLL基因的染色体重排外或许基因突变较少,相关研究或可以帮助靶向做种这种染色体重排来改善患儿的生存率。


    ALL往往在儿童出生的1年里发生,而且有时在婴儿出生时就会被诊断出来,患儿体内80%的白血病细胞都存在染色体重排的情况,其会将MLL基因融合入其它不同染色体的基因中,而MLL融合基因会编码一种异常蛋白质,这种融合蛋白在将正常血细胞转化为白血病细胞上扮演着重要的角色。


    文章中,研究者利用全基因组测序技术及其它技术鉴别出了65个ALL患儿机体的遗传突变,其中包括47个MLL基因重排的患儿;结果显示,尽管ALL作为一种恶性的白血病,但MLL重排后的亚型基因在任何报道的癌症中突变率最低;James R. Downing博士表示,本文研究为改善恶性白血病患者的生存率提供了一定帮助,同时我们也需要开发出作用MLL融合基因表达的异常蛋白的新型靶向药物,或者开发出新型药物来干扰MLL融合蛋白来关闭细胞中驱动肿瘤形成的细胞机器。


    目前研究者已经鉴别出了一些化合物,并且开发出了一种组合性疗法来帮助改善MLL重排的白血病患儿的机体健康;几乎一半的MLL重排的ALL患儿机体中名为PI3K-RAS通路的生化通路都存在活性突变,PI3K-RAS是一种酪氨酸激酶磷酸肌醇-3-激酶-RAS信号通路,该信号通路的突变通常仅在部分白血病细胞中存在;而当研究人员对癌症复发的患儿机体的白血病细胞进行分析后发现,在疾病复发时细胞中缺少突变的通路,实际上这种信号通路是在疾病复发时突变的,从而导致病人不能够从疗法中获益。


    相比婴儿而言,年龄较大的携带MLL重排的儿童白血病患者机体中的突变往往较为明显,本文研究中,研究者假设,在婴儿中,MLL重排发生于发育中的血细胞中,而这种血细胞则是出生前的一种祖细胞,其需要较少的突变就可以完全转化成为白血病细胞,相比较而言,在年龄较大的患者中MLL重排并不足以在血细胞中发生。


    原文链接:The landscape of somatic mutations in infant MLL-rearranged acute lymphoblastic leukemias


    Infant acute lymphoblastic leukemia (ALL) with MLL rearrangements (MLL-R) represents a distinct leukemia with a poor prognosis. To define its mutational landscape, we performed whole-genome, exome, RNA and targeted DNA sequencing on 65 infants (47 MLL-R and 18 non–MLL-R cases) and 20 older children (MLL-R cases) with leukemia. Our data show that infant MLL-R ALL has one of the lowest frequencies of somatic mutations of any sequenced cancer, with the predominant leukemic clone carrying a mean of 1.3 non-silent mutations. Despite this paucity of mutations, we detected activating mutations in kinase-PI3K-RAS signaling pathway components in 47% of cases. Surprisingly, these mutations were often subclonal and were frequently lost at relapse. In contrast to infant cases, MLL-R leukemia in older children had more somatic mutations (mean of 6.5 mutations/case versus 1.3 mutations/case, P = 7.15 × 10−5) and had frequent mutations (45%) in epigenetic regulators, a category of genes that, with the exception of MLL, was rarely mutated in infant MLL-R ALL.

 

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