当前位置 :主页 > 实验方法 > miRNA研究 >
2.1.10寡聚脱氧胸苷纤维素纯化带 poly( A)+RNA

试剂、试剂盒        

 

NaOH.寡聚脱氧胸苷 (oligo(dT) ] 纤维素DEPC 处理的水1X 加样缓冲液洗脱缓冲液 NaAc(pH5.2)乙醇 TE 缓冲液。


实验步骤      

  

一 材料与设备

 

1 ) 5 mol/L NaOH

 

2 ) 寡聚脱氧胸苷 (oligo(dT) ] 纤维素

 

3) DEPC 处理的水

 

4) 1X 加样缓冲液:20 mmol/L Tris-CL PH (6.7). 0.5 mol/L NaCl, l mmol/L EDTA( pH 8. 0 ). 0.1% 十二烷基肌氨酸钠

 

5 ) 洗脱缓冲液 : lO mmol/L Tris-Cl ( PH7. 6 ) l mmol/L EDTA( PH 8.0) 0.05% SDS

 

6) 3 mol/ L NaAc (pH5.2)

 

7 ) 乙醇

 

8) TE 缓冲液

 

 

二 操作方法

 

1) 先用 l0 ml5mol/LNaOH 清洗硅化的层析柱,然后用水冲洗。取 0.5 g oligodf) 纤维素干粉加于 1m]0.1mol/LNaOH 中,倒人柱内,以约 l0 ml 的水冲洗。(层析柱可用硅化的巴斯德吸管堵上已硅化的玻璃棉制成或用容量为 2 ml 的已硅化的一次性柱子

 

2) 1020℃ 加样缓冲液平衡柱子,至流出液 pH 7.5


3) 70°C 加热含 2 mg RNA 的水溶液 lOmin,迅速冷却至室温,加等体积的 2X 加样缓冲液,上样,立即用无菌试管收集流出液。并以一倍柱体积的加样缓冲液洗涤,将流出液于 70℃ 温育 5 min,重新上柱 2 次。

 

4) 510 倍柱体积的加样缓冲液洗柱,分步收集洗出液,每份 1 ml,测定每一收集管的 OD260。洗脱至 OD260 很小或为零。

 

5) 23 倍柱体积的洗脱缓冲液洗脱 Poly(A)ˉRNA,以 1/31/2 柱体积分步收集洗脱液。

 

6)调整所收集的 KNA 溶液的乙酸钠浓度至 0.3mol/L, 2.5 倍体积乙醇,一 20℃放置过夜或干冰/乙醇中 30 min

 

7) 4°C10000 g 离心 15mim 沉淀 RNA。弃去乙醇,再用 70% 乙醇洗沉淀. 弃去 70% 乙醇,晾干沉淀,重溶于少量无 RNA 酶的 TE 缓冲液。取在 70°C 加热 5 min 后,在 1% 琼脂糖凝胶电泳中检査 RNA 的质量。

 

S)poly(A)+1RNA 溶液可直接于 70℃ 保存,或加 3 倍体积乙醇保存于一 70


注意事项        


1 ) l ml oligo(dT)-纤维素最大载样量为 10 mg RNA,如果总 RNA 的量较少,应减少 oligo( (dT)-纤维素量 . 以免 poly( A)ˉ RNA 在过柱和后续步骤中损失。同时也避免浪费。

 

2 ) 加热 RNA 可以破坏可能的 poly( A)ˉ 尾的二级结构 。

 

3 ) 从加样的总 RNA 中可回收约 1% 2¾ puly(A)ˉ RNA,从 10^7 个哺乳动物细胞中可获得 15ug Poly( A)+RNA

 

4) 电泳检测 poly( A)+RNA 应在 20k h 以下并呈弥散状 ,且绝大多数集中在 510kb 范围

 

5 ) 十二烷基肌氨酸钠较难溶,若室温低于 18℃ 可能会阻碍柱内液体的流动,可用氯化锂代替加样缓冲液中的氯化钠以解决此问题。

来源:丁香通

上一篇:2.2.1 酚/SDS法制备植物RNA
下一篇:从富含多糖的植物组织中提取和纯化 RNA
分享到: