我们对真核基因组中最长基因被准确处理的机制很不了解。过去人们认为，内含子清除通常涉及单一的切除步骤。后来的研究显示，在果蝇中，一些内含子含有内部剪接点，它们会引起 “递归性剪接”，即单个内含子是在几个连续的剪接反应中一点儿一点儿被清除的。Brenton Graveley及同事发现，果蝇这一调控机制的范围要比人们所意识到的大得多。他们识别出果蝇的近200个“零核苷酸”外显子，这些外显子是“递归性剪接”的产物。Jernej Ule及同事识别出了脊椎动物的 “递归性剪接”点，尤其是在编码在神经发育中所涉及的蛋白的长基因中。对它们剪接的机制所做分析显示，这样的剪接点可以被用来指令不同的mRNA异构型。

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