当前位置 :主页 > 实验方法 > DNA实验技术 >
甲醛变性电泳检测RNA完整性

一、材料、试剂和仪器

 

1、材料:植物总RNA 5-10μg

 

2、试剂:

 

1)加样运载缓冲液(Loading buffer

 

50% 甘油


1mmol/L EDTA pH 8.0


0.25%溴酚蓝


25%二甲苯氰FF

 

210×TAE Buffer

 

35×甲醛凝胶电泳缓冲液:

 

0.1mol/L MOPs pH7.0


40mmol/L乙酸钠


5mmol/L DETApH8.0

 

4)甲醛,甲酰胺

 

3、仪器:电泳装置,紫外透射观测仪

 

二、实验程序

 

1、甲醛变性的琼脂糖(Agarose) 凝胶的配制

 

250mL的锥形瓶中准确称量2g Agarose Sigama),再加20mL 10×TAE Buffer144mLDEPC处理过的双蒸水,微波炉中化胶,待冷却至50-60℃加EB至终浓度≤0.5μg/mL。在通风橱中加入36 mL甲醛,放置一段时间以减少甲醛蒸汽。

 

2RNA的甲醛变性电泳


1) 样品制备

 

RNA总量10μg


5×甲醛凝胶电泳缓冲液4μl


甲醛 3.5μl


甲酰胺10μl

 

加入无菌离心管中混合,95℃水浴变性2min(或55℃,15min),取出后放入冰中冷却。

 

2) 加入2μl无菌的DEPC处理的加样运载液。(使用加样运载液的目的有三: 增大样品密度,以确保DNA均匀进入样品孔内;使样品呈现颜色,便于加样操作;能明确显现样品在电泳胶上的泳动位置。以 0.5 X TBE作电泳液时,溴苯酚在琼脂糖中的泳动速率与长 300 bp 的双链线状DNA相同,而二甲苯氰FF 的泳动速率与长4kb 的双链线状DNA相同。)

 

3)将胶板浸没在1×甲醛凝胶电泳缓冲液中,点样前5V/cm预跑5min。点样后3-4V/cm电泳。

 

4)电泳结束后(溴苯酚蓝迁移到约8cm处),紫外灯下观察, 照相。


此文转载来源:丁香通


上一篇:甲醛洋菜胶体电泳
下一篇:外源DNA片段在质粒载体中的克隆实验
分享到: