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异硫氰酸胍/氯化铯超速离心法制备 RNA 实验

这种方法源自于对 Chirgwin 等(1979) 所拟方案的修改。对 Chirgwin 等所规定的试剂,许多试剂盒中常用,且用于分离和纯化 RNA 的试剂也是常见的。


实验材料         


细胞和组织


试剂、试剂盒        

 

氯仿氯化铯溶液二硫苏糖醇EDTA乙醇异硫氰酸胍裂解缓冲液异丙醇N-月桂酰肌氨酸氯化锂液氮β-巯基乙醇苯酚


仪器、耗材     


离心机和转子研钵和杵超速离心管


实验步骤 

       

一、材料

 

1. 缓冲液、溶液和试剂

 

氯仿

 

氯化铯溶液,5.7mol/L(5.7mol/L 氯化铯,25 mmol/L 醋酸钠,pH6.01mmol/LEDTA,pH8.0)

 

用焦碳酸二乙酯(DEPC) 处理过的水

 

二硫苏糖醇(DTT)0.2 mmol/L

 

EDTA,1mmol/LpH8.0

 

乙醇,70%(体积分数)

 

异硫氰酸胍裂解缓冲液 (4mol/L 异硫氰酸胍,25 mmol/L 醋酸钠,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)

 

异丙醇

 

N-月桂酰肌氨酸,20%200 g/L)


氯化锂(LiCl),8mol/L

 

液氮

 

β-巯基乙醇,10 ml/L

 

苯酚, 水饱和,pH4.0

 

2. 离心机和转子

 

BeckmanTi50 转子或相当的转子

 

3. 特殊设备

 

研钵和杵,用 DEPC 处理过的水洗涤,预冷

 

超速离心管(异质同晶共聚材料),或相当的 Polygon, 或相当的高速匀浆器

 

4. 细胞和组织

 

细胞/组织,冻于液氮

 

二、方法

 

1. 使用研钵和杵在液氮下将样品研磨成细粉。使用 Polygon 均化器或其他合适的器具在 7 ml 胍裂解缓冲液中均质化组织或细胞(达 1X109 个)。

 

2. 4 ml5.7mol/L CsCl 溶液加到超速离心管中。

 

3. 1ml5.7mol/L CsCl 溶液、120ul10mol/L 的沒-巯基乙醇和 240ulN-月桂酰肌氨酸加到裂解产物中。


4. 将氯化铯/裂解产物混合物混合,小心使之位于离心管中的氯化铯溶液上分层。

 

5.20°C 180000 g 离心 21 h

 

6. 移弃氯化铯上清液,小心避免扰动管底的 RNA 沉降物。

 

7. 小心将 RNA 沉降物再溶解于 750ul 异硫氰酸胍裂解缓冲液中。

 

8. 加等体积酚,混匀。

 

9.10000g 离心 15 min

 

10. 将水相转移到一新管中。重复水相的酚抽提,直到界面变清。

 

11. 向清澈的水相加 1 倍体积氯仿。

 

12. 混合,l0000 g 离心 l0 min

 

13. 将水相转移到一干净试管中。加等体积的异丙酵和 1/10 体积 8mol/L 的氯化锂。10000g 离心10min

 

14. 移弃上清液。用 750ul70% 乙醇洗涤 RNA 沉降物,10000 g 离心。

 

15. 移弃乙酵,风干沉降物,再溶解于 50~500ul0.2 mmol/L DTT 中。

 

16.RNA 储存于-70°C




此文转载来源:丁香通

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