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从革兰氏阳性菌中分离RNA

实验材料         


10 ml 细菌培养物


试剂、试剂盒         


DEPC 处理的水 裂解缓冲液 酚氯仿异戊醇 5mol LNaCl 冰冷的无水乙醇 70% 乙醇 DNA 酶消化缓冲液 TE 缓冲液


仪器、耗材     


离心机 带微探头的超声仪


实验步骤    

    

一 材料与设备

 

1)10 ml 细菌培养物,

 

2)DEPC 处理的水。

 

3) 裂解缓冲液:30 mmol/LTris-Cl(PH7.4)100 mmol/LNaCl5 mmol/LEDTA1%(M/V)SDS, 使用前加蛋白酶 K 100ug/ml

 

4) 酚:氯仿:异戊醇 (25:24:1), 酚用 Tris-Cl(pH8.0) 平衡

 

5)24:1 氯仿:异戊醇

 

6)5mol/LNaCl

 

7) 冰冷的无水乙醇和 70% 乙醇。

 

8)DNA 酶消化缓冲液:20 mmol/LTris-Cl(pH8.0),10 mmol/LMgCI22.5 mg/ml RNA 酶的 DNA

 

9)TE 缓冲液 (PH8.0)

 

10) 离心机。


11) 带微探头的超声仪,

 

二 操作方法

 

1) 412000 g 离心,从 10 ml 细阐培养物中回收细胞,重悬菌体于 0.5 ml 裂解缓冲液,并移入微量离心管中,在干冰屮冻结

 

2) 解冻并用微探头超声仪以 30W 超声 3 次,每次 l0S,避免起泡,37℃ 温育 6Omin

 

3) 加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1) 抽提,于室温用微量离心机高速离心 3 min,上层水相移入另一干净微量离心管中。

 

4) 用酚:氯仿:异戊醇(2524:1) 再抽提 1 次,再用氯仿:异戊醇(24:1) 抽提 1次。

 

5)400ul 水相加入 15ul 5mol/LNaCl,并加满冰冷的无水乙醇,混匀并于冰上放置 1530 min 或于-20℃ 过夜

 

6)于 4℃ 用微量离心机离心 15 min 沉淀用冰冷的 70% 乙醇冲洗,晾干,用 95ul DMA 酶消化缓冲液溶解沉淀,加 4ul 2.5 mg/ml RNA 酶的 DNA I37℃ 温育60 min

 

7) 用酚:氯仿:异戊醇 (25:24:1) 抽提 1 次,移出水相,有机相加入 100ulTE 冲液,混匀,于室温下用微暈离心机高速离心5min,合并两次的水相。

 

8) 用氯仿:异戊醇(24:1) 抽提 1 次,加入 10ul 5mol/L NaCl 60ul 无水乙醇,在20°C 过夜或置于干冰/乙醇中 15 min 用微量离心机于 4℃ 下高速离心 1530 min


9) 500ul70% 乙醇洗涤沉淀,晾干。溶解于 100ulDEPC 处理过的水。取 10UL 稀释于 lml . A260 A280 以定量 RNA, 保存于-70℃ 或以乙醇沉淀的形式保存。

来源:丁香通

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